Rijeka Mississippi dom je raznih vodenih biljaka i životinja u složenom, međusobno povezanom ekosustavu. Vodene biljke pružaju hranu i utočište mnogim različitim vrstama u rijeci, a mogu biti malene koliko i jednoćelijske alge. Rijeka Mississippi sadrži niz životinja, od beskralježnjaka do riba, žaba i drugih.
Alge tvore zelenkaste listove i mogu obezbojati vodu.Alge
Prema Ministarstvu prirodnih resursa Iowa, Mississippi ugošćuje dvije glavne vrste algi: zelenu i plavozelenu. Zelene alge su osnovna biološka komponenta bilo kojeg zdravog ekosustava; oni stvaraju velike kolonije koje vode mogu dati zelenkastu cast. Plavo-zelene alge manje su poželjne i smatraju se algama štetnosti. Povezani su sa stresnim ekosustavima i mogu izazvati neugodne okuse u ribama ili ubiti čitavu populaciju.
Vodena leća
Ova uobičajena slobodno plutajuća biljka ima samo jedan maleni list i korijenje koji visi u vodi kako bi usisali hranjive tvari. Kao što mu i ime govori, patka je važan izvor hrane za mnoge vodotoke.
Lopoči
Bijeli ljiljani su uobičajeno mjesto u rijeci Mississippi, a sastoje se od velikih, plutajućih listova sa kožnom teksturom. Na vrhu lišća stvaraju velike bijele cvjetove, a ukorijenjeni su u blatu ispod.
Rak
Nazvani i rakovi ili gusjenice, ovi rakovi nalikuju malim jastozima. Prvenstveno su hranilice s dnom i konzumiraju ostatke drugih životinja, lešina i sitnih životinja. Domaći i invazivni rakovi žive u rijeci Mississippi.
Som
Kanalni som je uobičajen prizor u rijeci Mississippi. Oni su najbrojnija vrsta soma. Ove ribe mogu narasti do iznenađujuće veličine i drže se prvenstveno na riječnom dnu. Uočljiva je njihova sklonost udaranju različitih vrsta mamaca, ali treba ih jesti rijetko zbog opasnosti od onečišćenja PCB-om (poliklorirani bifenil).
Leopard žaba
Te pjegave žabe nazivaju se i livadnim žabama. Žive u rijeci Mississippi i oko nje. Oni često služe kao vrsta pokazatelja okoliša zbog svoje osjetljivosti na onečišćujuće i onečišćujuće tvari. Većinu svog vremena provode uz rubove potoka i drugih vodnih tijela, a jedu uglavnom insekte, člankonoše i druge beskralježnjake.