Zagađenje u bilo kojem obliku ima negativne učinke na okoliš i biljke koje se u njemu nalaze. Zagađenje ima mnogo izvora, od izravnog ispuštanja otpadnog ulja u vodene putove do onečišćenja zraka iz automobilskih izduva. Neki efekti su kratkoročni i lako se ublažavaju. Ostali učinci su dugoročni, a zagađivači se zadržavaju u okolini ili se nakupljaju u biljnom tkivu. Fotosinteza je važan proces unutar ekosustava. Koristeći sunčevu svjetlost, ugljični dioksid i vodu, biljke proizvode hranu i energiju u kemijskom procesu koji se događa u lišću biljke.
Zagađenje može smanjiti sposobnost biljke da prođe fotosintezu.Ozon i lišće
Zamjena plina kroz pore ili stomake lišća pruža potreban ugljični dioksid za fotosintezu. Međutim, studija iz 1980. objavljena u časopisu Cellular and Molecular Life Sciences otkrila je da zagađenje zraka smanjuje veličinu stomaka, ometajući razmjenu plina. Nedovoljno ugljičnog dioksida može usporiti ili zaustaviti fotosintezu. Tome u prilog ide i studija iz 2004. koja je utvrdila da zagađenje zraka smanjuje prinose usjeva.
Zagađenje izvora koji nisu u izvoru
Zagađivanje koje nije izvorište je onečišćenje koje dolazi iz različitih izvora i ulazi u okoliš kroz površinske vode. Prema američkoj Agenciji za zaštitu okoliša (EPA), odljev poljoprivrede je glavni izvor ove vrste onečišćenja. Otjecanje uvodi pesticide i gnojiva u vodene putove. Ponekad je učinak neposredan i biljke brzo umiru. Visoka razina fosfora iz gnojiva može uzrokovati cvjetanje algi. Cvjetanje algi uspostavljalo je scenarij u kojem se fotosinteza usporava i konačno zaustavlja jer pad razine otopljenog kisika u vodi i mutne vode ometaju protok sunčeve svjetlosti u vodene sredine.
Onečišćenje tla
Zagađenje tla utječe na fotosintezu na razini korijena. Kisela kiša uzrokovana emisijom fosilnih goriva povećava kiselost tla što uzrokuje nastanak kemikalije stvarajući otrovne ione aluminija. Ti ioni ometaju sposobnost biljke da preuzme hranjive tvari, usporavajući tako proces fotosinteze i ukupni rast biljke.
Efekt staklenika
Prizemni ozon nastao efektom staklene bašte može stvoriti nepovoljne uvjete za pojavu fotosinteze. Koncentracije stakleničkih plinova poput ugljičnog dioksida sprečavaju ispuštanje zračenja topline iz okoliša. Površinske temperature rastu, povećavajući brzinu isparavanja. Voda postaje ograničavajući faktor. Da bi sačuvale dragocjene resurse, biljke će zatvoriti svoje stomake, smanjujući tako biljku dostupnost ugljičnog dioksida. Uz ograničenje ugljičnog dioksida i vode, fotosinteza usporava.
Fizičko oštećenje
Zagađenje može ometati sposobnost biljke da prođe fotosintezu fizičkim oštećenjem lišća tamo gdje se pojavljuje. Ozon uzrokuje stanje zvano kloroza, u kojem lišće biljke požute od nedovoljne razine klorofila. Klorofil je važan za pojavu fotosinteze. Ako nivo padne, tako će biti i fotosinteza. Zagađenje može u visokim koncentracijama uništiti biljne strukture što će uzrokovati da biljke prestanu proizvoditi hranu kako bi se mogle nositi s stresima iz okoliša.
